Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm1O35954 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pitpnm1O35954 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pitpnm1O35954 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm1O35954 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms