Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpibO35906 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpibO35906 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpibO35906 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpibO35906 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpibO35906 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpibO35906 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpibO35906 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpibO35906 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpibO35906 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpibO35906 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpibO35906 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SpibO35906 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpibO35906 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpibO35906 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SpibO35906 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SpibO35906 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SpibO35906 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpibO35906 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpibO35906 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpibO35906 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpibO35906 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SpibO35906 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpibO35906 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpibO35906 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpibO35906 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpibO35906 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SpibO35906 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SpibO35906 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SpibO35906 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpibO35906 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpibO35906 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpibO35906 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpibO35906 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpibO35906 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpibO35906 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SpibO35906 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpibO35906 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpibO35906 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpibO35906 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpibO35906 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpibO35906 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpibO35906 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpibO35906 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpibO35906 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpibO35906 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpibO35906 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpibO35906 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpibO35906 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpibO35906 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpibO35906 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpibO35906 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpibO35906 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpibO35906 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpibO35906 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SpibO35906 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SpibO35906 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SpibO35906 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SpibO35906 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SpibO35906 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpibO35906 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpibO35906 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpibO35906 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpibO35906 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpibO35906 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpibO35906 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpibO35906 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpibO35906 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpibO35906 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpibO35906 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SpibO35906 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpibO35906 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpibO35906 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpibO35906 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpibO35906 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SpibO35906 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpibO35906 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpibO35906 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpibO35906 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpibO35906 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpibO35906 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpibO35906 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SpibO35906 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SpibO35906 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpibO35906 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SpibO35906 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SpibO35906 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SpibO35906 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SpibO35906 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms