Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3cdO35904 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pik3cdO35904 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pik3cdO35904 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pik3cdO35904 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms