Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CaluO35887 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CaluO35887 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CaluO35887 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CaluO35887 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CaluO35887 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CaluO35887 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CaluO35887 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CaluO35887 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CaluO35887 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CaluO35887 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CaluO35887 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CaluO35887 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CaluO35887 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CaluO35887 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CaluO35887 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CaluO35887 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CaluO35887 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CaluO35887 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CaluO35887 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CaluO35887 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CaluO35887 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CaluO35887 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CaluO35887 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CaluO35887 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CaluO35887 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaluO35887 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaluO35887 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaluO35887 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaluO35887 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaluO35887 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaluO35887 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CaluO35887 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CaluO35887 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CaluO35887 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CaluO35887 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CaluO35887 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CaluO35887 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CaluO35887 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaluO35887 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CaluO35887 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaluO35887 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaluO35887 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CaluO35887 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CaluO35887 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CaluO35887 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CaluO35887 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CaluO35887 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CaluO35887 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CaluO35887 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CaluO35887 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CaluO35887 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CaluO35887 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CaluO35887 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CaluO35887 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CaluO35887 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CaluO35887 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CaluO35887 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CaluO35887 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CaluO35887 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CaluO35887 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CaluO35887 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CaluO35887 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CaluO35887 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CaluO35887 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CaluO35887 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CaluO35887 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CaluO35887 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CaluO35887 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CaluO35887 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CaluO35887 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CaluO35887 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms