Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops5O35864 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops5O35864 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops5O35864 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cops5O35864 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops5O35864 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops5O35864 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cops5O35864 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops5O35864 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops5O35864 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cops5O35864 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms