Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NudcO35685 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NudcO35685 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NudcO35685 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NudcO35685 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NudcO35685 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NudcO35685 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NudcO35685 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NudcO35685 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NudcO35685 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NudcO35685 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NudcO35685 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NudcO35685 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NudcO35685 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NudcO35685 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NudcO35685 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NudcO35685 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NudcO35685 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NudcO35685 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NudcO35685 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NudcO35685 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NudcO35685 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NudcO35685 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NudcO35685 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NudcO35685 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NudcO35685 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NudcO35685 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NudcO35685 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NudcO35685 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NudcO35685 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NudcO35685 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NudcO35685 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NudcO35685 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NudcO35685 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NudcO35685 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NudcO35685 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NudcO35685 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NudcO35685 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NudcO35685 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NudcO35685 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NudcO35685 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NudcO35685 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NudcO35685 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NudcO35685 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NudcO35685 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NudcO35685 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NudcO35685 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NudcO35685 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NudcO35685 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NudcO35685 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NudcO35685 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NudcO35685 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NudcO35685 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NudcO35685 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NudcO35685 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NudcO35685 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NudcO35685 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NudcO35685 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NudcO35685 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NudcO35685 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NudcO35685 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NudcO35685 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NudcO35685 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NudcO35685 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NudcO35685 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NudcO35685 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NudcO35685 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NudcO35685 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NudcO35685 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NudcO35685 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NudcO35685 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NudcO35685 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NudcO35685 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NudcO35685 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NudcO35685 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NudcO35685 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NudcO35685 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms