Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RaxO35602 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaxO35602 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaxO35602 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaxO35602 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaxO35602 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RaxO35602 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RaxO35602 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaxO35602 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaxO35602 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaxO35602 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RaxO35602 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaxO35602 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RaxO35602 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaxO35602 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaxO35602 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaxO35602 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RaxO35602 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaxO35602 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaxO35602 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaxO35602 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaxO35602 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RaxO35602 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RaxO35602 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaxO35602 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaxO35602 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaxO35602 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaxO35602 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaxO35602 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaxO35602 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaxO35602 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaxO35602 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaxO35602 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaxO35602 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaxO35602 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaxO35602 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaxO35602 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaxO35602 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaxO35602 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaxO35602 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaxO35602 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaxO35602 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaxO35602 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaxO35602 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaxO35602 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaxO35602 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaxO35602 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaxO35602 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RaxO35602 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaxO35602 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaxO35602 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaxO35602 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaxO35602 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaxO35602 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaxO35602 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaxO35602 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaxO35602 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaxO35602 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RaxO35602 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaxO35602 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaxO35602 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaxO35602 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaxO35602 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaxO35602 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaxO35602 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaxO35602 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaxO35602 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaxO35602 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaxO35602 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RaxO35602 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaxO35602 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaxO35602 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RaxO35602 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaxO35602 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaxO35602 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaxO35602 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RaxO35602 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RaxO35602 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms