Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Abcc1O35379 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Abcc1O35379 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Abcc1O35379 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc1O35379 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc1O35379 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc1O35379 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms