Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh2d1bO35324 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d1bO35324 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d1bO35324 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d1bO35324 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d1bO35324 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh2d1bO35324 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sh2d1bO35324 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh2d1bO35324 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh2d1bO35324 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms