Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad6O35182 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad6O35182 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad6O35182 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad6O35182 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smad6O35182 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad6O35182 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad6O35182 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms