Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snap23O09044 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snap23O09044 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Snap23O09044 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snap23O09044 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snap23O09044 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snap23O09044 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Snap23O09044 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms