Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrkcshO08795 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcshO08795 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkcshO08795 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms