Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fpr-s1O08790 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fpr-s1O08790 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fpr-s1O08790 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms