Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dctn1O08788 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dctn1O08788 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dctn1O08788 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dctn1O08788 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms