Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltaO08585 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltaO08585 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CltaO08585 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltaO08585 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltaO08585 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltaO08585 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltaO08585 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CltaO08585 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltaO08585 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltaO08585 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltaO08585 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CltaO08585 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CltaO08585 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CltaO08585 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltaO08585 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CltaO08585 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CltaO08585 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CltaO08585 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltaO08585 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltaO08585 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltaO08585 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltaO08585 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltaO08585 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CltaO08585 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltaO08585 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltaO08585 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltaO08585 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CltaO08585 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltaO08585 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltaO08585 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltaO08585 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CltaO08585 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltaO08585 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltaO08585 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CltaO08585 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltaO08585 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltaO08585 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CltaO08585 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CltaO08585 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CltaO08585 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CltaO08585 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CltaO08585 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltaO08585 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltaO08585 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltaO08585 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltaO08585 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltaO08585 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltaO08585 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CltaO08585 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CltaO08585 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltaO08585 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltaO08585 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CltaO08585 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltaO08585 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltaO08585 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltaO08585 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltaO08585 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltaO08585 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltaO08585 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CltaO08585 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltaO08585 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltaO08585 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltaO08585 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CltaO08585 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltaO08585 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CltaO08585 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltaO08585 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CltaO08585 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CltaO08585 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CltaO08585 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CltaO08585 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CltaO08585 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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