Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klf6O08584 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf6O08584 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf6O08584 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf6O08584 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf6O08584 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klf6O08584 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf6O08584 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf6O08584 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf6O08584 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms