Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn2O08529 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn2O08529 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn2O08529 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn2O08529 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn2O08529 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn2O08529 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn2O08529 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn2O08529 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn2O08529 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn2O08529 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn2O08529 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn2O08529 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn2O08529 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn2O08529 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn2O08529 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms