Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm20939L7N243 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20939L7N243 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms