Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm8298J3QPI0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8298J3QPI0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms