Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20873J3QMQ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20873J3QMQ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20873J3QMQ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20873J3QMQ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20873J3QMQ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20873J3QMQ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm20873J3QMQ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm20873J3QMQ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20873J3QMQ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm20873J3QMQ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Gm20873J3QMQ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm20873J3QMQ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm20873J3QMQ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm20873J3QMQ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gm20873J3QMQ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gm20873J3QMQ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20873J3QMQ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20873J3QMQ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20873J3QMQ9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20873J3QMQ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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