Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh19G5E8H9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh19G5E8H9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh19G5E8H9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms