Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcf11G3X9Z4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pcf11G3X9Z4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pcf11G3X9Z4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Pcf11G3X9Z4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcf11G3X9Z4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcf11G3X9Z4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms