Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf148G3X9R7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf148G3X9R7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf148G3X9R7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf148G3X9R7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms