Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h12bG3X9I7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h12bG3X9I7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h12bG3X9I7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h12bG3X9I7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms