Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r39G3UWE6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r39G3UWE6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r39G3UWE6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms