Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn2r85G3UW56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn2r85G3UW56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r85G3UW56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r85G3UW56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r85G3UW56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r85G3UW56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r85G3UW56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r85G3UW56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms