Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4aF8VPX6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Speer4aF8VPX6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Speer4aF8VPX6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Speer4aF8VPX6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms