Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2564F6Z9S8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm2564F6Z9S8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm2564F6Z9S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm2564F6Z9S8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm2564F6Z9S8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm2564F6Z9S8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm2564F6Z9S8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm2564F6Z9S8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm2564F6Z9S8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm2564F6Z9S8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm2564F6Z9S8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm2564F6Z9S8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm2564F6Z9S8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms