Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21970F6XX07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21970F6XX07 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21970F6XX07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms