Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3072F6SKY8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm3072F6SKY8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms