Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm340F6RGI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm340F6RGI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm340F6RGI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms