Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mcmdc2E9Q956 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mcmdc2E9Q956 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mcmdc2E9Q956 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcmdc2E9Q956 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcmdc2E9Q956 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcmdc2E9Q956 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcmdc2E9Q956 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcmdc2E9Q956 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mcmdc2E9Q956 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms