Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn2r56E9Q4U5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r56E9Q4U5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn2r56E9Q4U5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms