Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Susd1E9Q3H4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Susd1E9Q3H4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms