Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
5430401F13RikE9Q328 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
5430401F13RikE9Q328 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms