Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdr1E9Q0B4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr1E9Q0B4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdr1E9Q0B4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms