Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph10bE9PYQ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rsph10bE9PYQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph10bE9PYQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms