Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc175E9PVB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc175E9PVB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms