Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc24E9PUW8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc24E9PUW8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc24E9PUW8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc24E9PUW8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms