Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb5B5X0E4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb5B5X0E4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcb5B5X0E4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcb5B5X0E4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms