Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc11B2RXC1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc11B2RXC1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc11B2RXC1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms