Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Siah3B2RWG3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Siah3B2RWG3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Siah3B2RWG3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Siah3B2RWG3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms