Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AU015836B2RUM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AU015836B2RUM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AU015836B2RUM3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AU015836B2RUM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms