Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Uhrf1bp1B2KF50 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Uhrf1bp1B2KF50 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Uhrf1bp1B2KF50 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms