Protein–RNA interactions for Protein: B1AQB1

Gm11569, Predicted gene 11569, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11569B1AQB1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm11569B1AQB1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm11569B1AQB1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm11569B1AQB1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms