Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930435E12RikA6X8Z9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930435E12RikA6X8Z9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930435E12RikA6X8Z9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms