Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prr16A3KMN5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prr16A3KMN5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prr16A3KMN5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prr16A3KMN5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms