Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samt1A2BED8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt1A2BED8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt1A2BED8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms