Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb1A2AQ07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb1A2AQ07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubb1A2AQ07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms