Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GabreA2AMW3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GabreA2AMW3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GabreA2AMW3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms